MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623

Total Repeats: 157973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019966	AGC	2	6	195107	195112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645049
5002	NC_019966	CCA	2	6	195117	195122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433645049
5003	NC_019966	CTC	2	6	195169	195174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433645049
5004	NC_019966	TCG	2	6	195206	195211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645049
5005	NC_019966	CCG	2	6	195296	195301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645049
5006	NC_019966	GCA	2	6	195303	195308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645049
5007	NC_019966	CAG	2	6	195415	195420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645049
5008	NC_019966	GCCAC	2	10	195426	195435	20 %	0 %	20 %	60 %	433645049
5009	NC_019966	ATC	2	6	195446	195451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433645049
5010	NC_019966	GCA	2	6	195486	195491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645049
5011	NC_019966	CGT	2	6	195527	195532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645050
5012	NC_019966	GC	3	6	195544	195549	0 %	0 %	50 %	50 %	433645050
5013	NC_019966	GCG	2	6	195558	195563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645050
5014	NC_019966	GCG	2	6	195595	195600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645050
5015	NC_019966	CGG	2	6	195729	195734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645050
5016	NC_019966	GCC	2	6	195752	195757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645050
5017	NC_019966	CG	3	6	195798	195803	0 %	0 %	50 %	50 %	433645050
5018	NC_019966	GCC	2	6	195828	195833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645050
5019	NC_019966	TCG	2	6	195847	195852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645050
5020	NC_019966	CGG	2	6	195864	195869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645050
5021	NC_019966	GC	3	6	195884	195889	0 %	0 %	50 %	50 %	433645050
5022	NC_019966	CG	4	8	195940	195947	0 %	0 %	50 %	50 %	433645050
5023	NC_019966	GGC	2	6	195957	195962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645050
5024	NC_019966	CAGC	2	8	196008	196015	25 %	0 %	25 %	50 %	433645050
5025	NC_019966	ACG	2	6	196052	196057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645050
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5027	NC_019966	CAA	2	6	196140	196145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433645050
5028	NC_019966	CGG	2	6	196157	196162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645050
5029	NC_019966	GCGCC	2	10	196181	196190	0 %	0 %	40 %	60 %	433645050
5030	NC_019966	CAC	2	6	196218	196223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433645050
5031	NC_019966	GTCGG	2	10	196224	196233	0 %	20 %	60 %	20 %	433645050
5032	NC_019966	CAG	2	6	196245	196250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645050
5033	NC_019966	CGG	2	6	196271	196276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645050
5034	NC_019966	CCG	3	9	196288	196296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645050
5035	NC_019966	ACG	2	6	196338	196343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_019966	CGG	2	6	196344	196349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_019966	TCG	2	6	196387	196392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645051
5038	NC_019966	TG	3	6	196395	196400	0 %	50 %	50 %	0 %	433645051
5039	NC_019966	GGC	2	6	196405	196410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645051
5040	NC_019966	GGC	2	6	196426	196431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645051
5041	NC_019966	TCG	2	6	196436	196441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645051
5042	NC_019966	CGA	2	6	196467	196472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645051
5043	NC_019966	TGC	2	6	196489	196494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645051
5044	NC_019966	TGCGCC	2	12	196501	196512	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433645051
5045	NC_019966	GGC	2	6	196513	196518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645051
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5047	NC_019966	GCT	2	6	196555	196560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645051
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5050	NC_019966	ACC	2	6	196647	196652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433645051
5051	NC_019966	GACC	2	8	196681	196688	25 %	0 %	25 %	50 %	433645051
5052	NC_019966	CGA	2	6	196759	196764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645051
5053	NC_019966	GGC	2	6	196769	196774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645051
5054	NC_019966	CAGC	2	8	196804	196811	25 %	0 %	25 %	50 %	433645051
5055	NC_019966	GCCA	2	8	196832	196839	25 %	0 %	25 %	50 %	433645051
5056	NC_019966	AGA	2	6	196846	196851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433645051
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5058	NC_019966	CGT	2	6	196921	196926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645051
5059	NC_019966	CGA	2	6	196945	196950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645051
5060	NC_019966	CGG	2	6	196986	196991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645051
5061	NC_019966	CCT	2	6	197041	197046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433645051
5062	NC_019966	CGGCCA	2	12	197068	197079	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433645051
5063	NC_019966	AC	5	10	197091	197100	50 %	0 %	0 %	50 %	433645051
5064	NC_019966	GTC	2	6	197108	197113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645051
5065	NC_019966	CGC	2	6	197118	197123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645051
5066	NC_019966	GCAG	2	8	197134	197141	25 %	0 %	50 %	25 %	433645051
5067	NC_019966	TGATC	2	10	197143	197152	20 %	40 %	20 %	20 %	433645051
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5071	NC_019966	CGG	2	6	197284	197289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645051
5072	NC_019966	CGA	2	6	197317	197322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645051
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5077	NC_019966	GCGGT	2	10	197593	197602	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5078	NC_019966	CGA	2	6	197653	197658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645052
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5080	NC_019966	GGCGC	2	10	197723	197732	0 %	0 %	60 %	40 %	433645052
5081	NC_019966	CCGAG	2	10	197740	197749	20 %	0 %	40 %	40 %	433645052
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5086	NC_019966	ATCGG	2	10	197994	198003	20 %	20 %	40 %	20 %	433645052
5087	NC_019966	CAGATC	2	12	198011	198022	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	433645052
5088	NC_019966	CGG	2	6	198067	198072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645052
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5101	NC_019966	ACG	2	6	198598	198603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645052
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5107	NC_019966	GCG	3	9	198887	198895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_019966	GTA	2	6	198921	198926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_019966	CAC	2	6	198927	198932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5110	NC_019966	ACC	2	6	198956	198961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5111	NC_019966	GCG	2	6	198965	198970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_019966	GCC	2	6	199045	199050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_019966	CTG	2	6	199058	199063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_019966	ACT	2	6	199069	199074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5116	NC_019966	CGCA	2	8	199108	199115	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5117	NC_019966	GGA	2	6	199131	199136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_019966	ACT	2	6	199152	199157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_019966	CG	3	6	199247	199252	0 %	0 %	50 %	50 %	433645053
5120	NC_019966	CAG	2	6	199264	199269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645053
5121	NC_019966	CGC	2	6	199278	199283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645053
5122	NC_019966	TCT	2	6	199292	199297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433645053
5123	NC_019966	GATG	2	8	199323	199330	25 %	25 %	50 %	0 %	433645053
5124	NC_019966	CGC	2	6	199335	199340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645053
5125	NC_019966	CTGTAT	2	12	199366	199377	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	433645053
5126	NC_019966	AGG	2	6	199388	199393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433645053
5127	NC_019966	TCG	2	6	199433	199438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645053
5128	NC_019966	ACG	2	6	199439	199444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645053
5129	NC_019966	GCA	2	6	199448	199453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645053
5130	NC_019966	TGC	2	6	199484	199489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645053
5131	NC_019966	CGT	2	6	199535	199540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645053
5132	NC_019966	CCA	2	6	199562	199567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433645053
5133	NC_019966	ATC	2	6	199612	199617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433645053
5134	NC_019966	GCT	2	6	199632	199637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645053
5135	NC_019966	ATG	2	6	199681	199686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433645053
5136	NC_019966	CGC	2	6	199719	199724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645053
5137	NC_019966	GCC	2	6	199759	199764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645053
5138	NC_019966	TGA	2	6	199769	199774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433645053
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5140	NC_019966	AGC	2	6	199856	199861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5141	NC_019966	TGC	2	6	199887	199892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645054
5142	NC_019966	CTC	2	6	199925	199930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433645054
5143	NC_019966	ATG	2	6	199982	199987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433645054
5144	NC_019966	CG	4	8	200056	200063	0 %	0 %	50 %	50 %	433645054
5145	NC_019966	TGCG	2	8	200076	200083	0 %	25 %	50 %	25 %	433645054
5146	NC_019966	CGTTC	2	10	200095	200104	0 %	40 %	20 %	40 %	433645054
5147	NC_019966	G	6	6	200124	200129	0 %	0 %	100 %	0 %	433645054
5148	NC_019966	TC	3	6	200132	200137	0 %	50 %	0 %	50 %	433645054
5149	NC_019966	TTC	2	6	200255	200260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433645054
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5152	NC_019966	TCT	2	6	200323	200328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433645054
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5155	NC_019966	GCT	2	6	200446	200451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645054
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5160	NC_019966	CGACG	2	10	200632	200641	20 %	0 %	40 %	40 %	433645054
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5171	NC_019966	ACC	2	6	201146	201151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433645054
5172	NC_019966	CGT	2	6	201153	201158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645054
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5180	NC_019966	GC	3	6	201389	201394	0 %	0 %	50 %	50 %	433645054
5181	NC_019966	TGC	2	6	201420	201425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645054
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5186	NC_019966	CGG	2	6	201779	201784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645055
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5210	NC_019966	TGG	2	6	202632	202637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5211	NC_019966	TCGCA	2	10	202702	202711	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5212	NC_019966	TCG	2	6	202771	202776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645056
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5222	NC_019966	TCCGG	2	10	203397	203406	0 %	20 %	40 %	40 %	433645057
5223	NC_019966	CGGG	2	8	203453	203460	0 %	0 %	75 %	25 %	433645057
5224	NC_019966	TG	3	6	203508	203513	0 %	50 %	50 %	0 %	433645057
5225	NC_019966	TGA	2	6	203525	203530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433645057
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5232	NC_019966	GCT	2	6	203954	203959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645058
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5240	NC_019966	GCC	2	6	204403	204408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645058
5241	NC_019966	GC	3	6	204409	204414	0 %	0 %	50 %	50 %	433645058
5242	NC_019966	TCA	2	6	204422	204427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433645058
5243	NC_019966	GCC	2	6	204559	204564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645059
5244	NC_019966	GCC	2	6	204582	204587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645059
5245	NC_019966	GCC	2	6	204689	204694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645059
5246	NC_019966	TGG	2	6	204726	204731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433645059
5247	NC_019966	CGA	2	6	204775	204780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645059
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5250	NC_019966	CGA	2	6	204867	204872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645059
5251	NC_019966	CAG	2	6	204904	204909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645059
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5253	NC_019966	TCG	2	6	205004	205009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645059
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5255	NC_019966	TCGACG	2	12	205082	205093	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433645059
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5262	NC_019966	CGA	4	12	205452	205463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645059
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5264	NC_019966	GAA	2	6	205501	205506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433645059
5265	NC_019966	GCC	2	6	205588	205593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645059
5266	NC_019966	ACG	2	6	205607	205612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645059
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5268	NC_019966	ACG	2	6	205649	205654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645059
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5270	NC_019966	CAG	2	6	205672	205677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645059
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5272	NC_019966	GCG	2	6	205689	205694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645059
5273	NC_019966	AAG	2	6	205828	205833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5274	NC_019966	CGG	2	6	205888	205893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645060
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5291	NC_019966	GCGAC	2	10	206607	206616	20 %	0 %	40 %	40 %	433645060
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5300	NC_019966	GGT	2	6	206872	206877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433645060
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5302	NC_019966	GCTCG	2	10	206944	206953	0 %	20 %	40 %	40 %	433645060
5303	NC_019966	TCAACG	2	12	206970	206981	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	433645060
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5309	NC_019966	C	6	6	207227	207232	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5310	NC_019966	TCAGCC	2	12	207296	207307	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433645061
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5315	NC_019966	CTG	2	6	207430	207435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645061
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5341	NC_019966	CG	3	6	208324	208329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5342	NC_019966	AAT	2	6	208332	208337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5343	NC_019966	TCC	2	6	208354	208359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5344	NC_019966	TGC	2	6	208450	208455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5347	NC_019966	ACC	2	6	208525	208530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5349	NC_019966	TCG	2	6	208561	208566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5350	NC_019966	GTC	2	6	208602	208607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5352	NC_019966	GC	4	8	208711	208718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5353	NC_019966	GTA	2	6	208745	208750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5354	NC_019966	GGT	2	6	208759	208764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5355	NC_019966	GTC	3	9	208784	208792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5356	NC_019966	GAC	2	6	208821	208826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5357	NC_019966	CGT	2	6	208846	208851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5358	NC_019966	TCAC	2	8	208932	208939	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5359	NC_019966	CTG	2	6	208943	208948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5360	NC_019966	GTG	3	9	208995	209003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5361	NC_019966	CCG	2	6	209037	209042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5362	NC_019966	GTT	2	6	209164	209169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5363	NC_019966	CGC	3	9	209217	209225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645062
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5426	NC_019966	GCC	2	6	212335	212340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5475	NC_019966	CTT	2	6	214417	214422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433645065
5476	NC_019966	CGA	2	6	214488	214493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645065
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5479	NC_019966	TCG	2	6	214672	214677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5480	NC_019966	CCA	2	6	214716	214721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5481	NC_019966	TCA	2	6	214869	214874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5482	NC_019966	TCGCG	2	10	214903	214912	0 %	20 %	40 %	40 %	433645066
5483	NC_019966	CGC	2	6	215023	215028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645066
5484	NC_019966	CG	3	6	215035	215040	0 %	0 %	50 %	50 %	433645066
5485	NC_019966	ACC	2	6	215069	215074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433645066
5486	NC_019966	CGC	2	6	215083	215088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645066
5487	NC_019966	CGA	2	6	215140	215145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645066
5488	NC_019966	CTGC	2	8	215167	215174	0 %	25 %	25 %	50 %	433645066
5489	NC_019966	CGT	2	6	215188	215193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645066
5490	NC_019966	CGC	2	6	215232	215237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645066
5491	NC_019966	GCC	2	6	215264	215269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645066
5492	NC_019966	CGG	2	6	215275	215280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645066
5493	NC_019966	ACG	2	6	215322	215327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433645066
5494	NC_019966	CAT	2	6	215335	215340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433645066
5495	NC_019966	CGC	2	6	215341	215346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433645066
5496	NC_019966	ACT	2	6	215394	215399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433645066
5497	NC_019966	CGG	2	6	215443	215448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645066
5498	NC_019966	GAT	2	6	215467	215472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433645066
5499	NC_019966	GCT	2	6	215473	215478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433645066
5500	NC_019966	GGC	2	6	215504	215509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433645066

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